04 Phương Thức Nộp Thuế Điện Tử Trong Xuất Nhập Khẩu Áp Dụng Từ 07/8/2025
Ngày 24/6/2025, Bộ trưởng Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định thủ tục giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh.
Một điểm đáng chú ý là từ 07/8/2025, sẽ chính thức áp dụng 04 phương thức nộp thuế điện tử mới cho hoạt động xuất nhập khẩu.
1. Nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan
Người nộp thuế (NNT) có thể trực tiếp truy cập Cổng thanh toán điện tử hải quan để tra cứu thông tin khoản phải nộp. Sau đó, lựa chọn khoản nộp ngân sách nhà nước (NSNN), hệ thống sẽ hỗ trợ lập giấy nộp tiền theo mẫu của Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
NNT cần kiểm tra thông tin, chọn ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán, hoặc Kho bạc Nhà nước, rồi ký số để yêu cầu trích tiền nộp vào NSNN.
Trong quá trình thực hiện, có một số trường hợp cần lưu ý:
-
Nếu khoản thuế phải nộp thuộc các tài khoản thu khác nhau, NNT phải lập giấy nộp tiền riêng cho từng tài khoản.
-
Với khoản nộp chưa có sẵn trên hệ thống, NNT tự lập chứng từ đầy đủ, chọn đơn vị thanh toán và ký số để hoàn tất.
-
Khi nộp phí, lệ phí hải quan cho nhiều tờ khai, NNT nhập số tờ khai đại diện 9999999999 (10 số 9) kèm tổng số tiền, sau đó ký số để hệ thống trích nộp.
2. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán đã phối hợp thu
Ở phương thức này, NNT truy cập cổng trao đổi thông tin của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán (đã ký kết phối hợp thu với cơ quan hải quan) để lập chứng từ nộp NSNN theo mẫu của Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
Nếu nộp phí, lệ phí cho nhiều tờ khai, NNT thực hiện theo quy định tại điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
3. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng vừa phối hợp thu, vừa có ủy nhiệm thu với Kho bạc Nhà nước
Với hình thức này, NNT thực hiện lập chứng từ nộp NSNN trên cổng trao đổi thông tin của ngân hàng theo mẫu ban hành kèm Nghị định 11/2020/NĐ-CP.
Quy trình xử lý có thể xảy ra các tình huống:
-
Thông tin khớp với dữ liệu trên Cổng thanh toán điện tử hải quan: Ngân hàng trích tiền ngay và gửi thông tin thu về hệ thống hải quan.
-
Thông tin chưa khớp (trừ số tiền): Hệ thống ngân hàng phản hồi để NNT chỉnh sửa trước khi trích tiền.
-
Sai khác về số tiền: Thực hiện theo hướng dẫn tại điểm c khoản 2 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
-
Không có thông tin trên hệ thống hải quan: NNT cần kiểm tra, bổ sung hoặc phản hồi trên Cổng thông tin điện tử hải quan trước khi thanh toán.
-
Không truyền nhận được dữ liệu giữa hệ thống hải quan và ngân hàng: NNT cung cấp chứng từ nộp NSNN có mã vạch để ngân hàng quét và xử lý.
-
Thanh toán liên ngân hàng: Ngân hàng đối chiếu thông tin, xử lý theo các bước nêu ở trên; nếu có sai sót thì áp dụng quy định tại Điều 16, 17, 19 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Tương tự các phương thức khác, nếu nộp cho nhiều tờ khai, NNT thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
4. Nộp thuế điện tử qua ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa phối hợp thu
Trường hợp ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa phối hợp thu với cơ quan hải quan, NNT vẫn có thể lập chứng từ nộp NSNN theo mẫu tại Phụ lục I Nghị định 11/2020/NĐ-CP trên hệ thống ứng dụng của đơn vị đó.
Khi nộp phí, lệ phí cho nhiều tờ khai, NNT tiếp tục thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Kết luận
Từ 07/8/2025, các doanh nghiệp và cá nhân tham gia hoạt động xuất nhập khẩu sẽ có thêm nhiều lựa chọn linh hoạt trong việc nộp thuế điện tử. Việc áp dụng 04 phương thức nêu trên không chỉ giúp tối ưu quy trình thanh toán mà còn đảm bảo tính minh bạch, nhanh chóng và an toàn trong quản lý thuế hải quan.