Dự kiến thời gian hết hiệu lực Nghị định 139/2016/NĐ-CP về lệ phí môn bài

Nghị định 139/2016/NĐ-CP của Chính phủ quy định về lệ phí môn bài đã được áp dụng trong nhiều năm qua và trở thành căn cứ pháp lý quan trọng để quản lý nghĩa vụ nộp lệ phí môn bài của doanh nghiệp, hộ kinh doanh và các tổ chức, cá nhân.
Tuy nhiên, theo định hướng chính sách mới tại Nghị quyết 198/2025/QH15 về phát triển kinh tế tư nhân, lệ phí môn bài sẽ chính thức bị bãi bỏ. Điều này đồng nghĩa với việc Nghị định 139/2016/NĐ-CP dự kiến hết hiệu lực từ ngày 01/01/2026.

1. Thời điểm dự kiến bãi bỏ Nghị định 139/2016/NĐ-CP

Trong Dự thảo Nghị định hướng dẫn thi hành Nghị quyết 198/2025/QH15 (lần 4) do Bộ Tài chính công bố, một trong những điểm đáng chú ý là bãi bỏ toàn bộ Nghị định 139/2016/NĐ-CP ngày 04/10/2016 và Nghị định 22/2020/NĐ-CP ngày 20/02/2020 – văn bản đã từng sửa đổi, bổ sung một số quy định về lệ phí môn bài.

Như vậy, nếu dự thảo được thông qua và ban hành chính thức, Nghị định 139/2016/NĐ-CP sẽ hết hiệu lực kể từ ngày 01/01/2026. Đây là một trong những thay đổi quan trọng trong chính sách thuế – phí, thể hiện chủ trương giảm bớt gánh nặng hành chính và tài chính cho doanh nghiệp, hộ kinh doanh trong giai đoạn tới.

2. Các chính sách hỗ trợ thuế, phí, lệ phí tại Nghị quyết 198/2025/QH15

Không chỉ dừng lại ở việc bãi bỏ lệ phí môn bài, Nghị quyết 198/2025/QH15 còn ban hành nhiều chính sách ưu đãi và hỗ trợ liên quan đến thuế, phí nhằm thúc đẩy sự phát triển của khu vực kinh tế tư nhân. Một số điểm nổi bật có thể kể đến như:

Thứ nhất, doanh nghiệp khởi nghiệp đổi mới sáng tạo được hưởng ưu đãi đặc biệt về thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN). Cụ thể, doanh nghiệp sẽ được miễn TNDN trong 2 năm đầu hoạt động và giảm 50% trong 4 năm tiếp theo đối với phần thu nhập phát sinh từ hoạt động khởi nghiệp đổi mới sáng tạo. Chính sách này cũng áp dụng cho các công ty quản lý quỹ đầu tư khởi nghiệp và các tổ chức trung gian hỗ trợ khởi nghiệp.

Thứ hai, thu nhập từ chuyển nhượng vốn, cổ phần, quyền góp vốn liên quan đến doanh nghiệp khởi nghiệp đổi mới sáng tạo được miễn cả thuế TNDN và thuế thu nhập cá nhân. Đây là cơ chế khuyến khích các nhà đầu tư rót vốn mạnh mẽ hơn vào lĩnh vực khởi nghiệp.

Thứ ba, các chuyên gia, nhà khoa học làm việc cho doanh nghiệp khởi nghiệp hoặc các trung tâm nghiên cứu – đổi mới sáng tạo cũng được hưởng ưu đãi thuế thu nhập cá nhân. Cụ thể, họ sẽ được miễn thuế trong 2 năm và giảm 50% trong 4 năm tiếp theo đối với phần thu nhập từ tiền lương, tiền công.

Thứ tư, doanh nghiệp nhỏ và vừa khi thành lập mới sẽ được miễn thuế thu nhập doanh nghiệp trong 3 năm đầu, giúp giảm bớt chi phí khởi sự kinh doanh và tăng khả năng cạnh tranh trên thị trường.

Thứ năm, các chi phí đào tạo nhân lực của doanh nghiệp lớn khi hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa trong chuỗi cung ứng được tính vào chi phí hợp lý khi xác định thu nhập chịu thuế. Đây là điểm mới quan trọng, khuyến khích sự liên kết giữa các doanh nghiệp trong chuỗi giá trị.

Bên cạnh đó, từ 01/01/2026, hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh sẽ không còn áp dụng phương pháp khoán thuế. Việc nộp thuế sẽ được thực hiện theo cơ chế quản lý thuế thống nhất, minh bạch và phù hợp với quy định tại Luật Quản lý thuế.

Ngoài ra, một số lệ phí và phí hành chính cũng sẽ được miễn trong trường hợp tổ chức, cá nhân, doanh nghiệp phải làm thủ tục cấp lại, cấp đổi giấy tờ do quá trình sắp xếp, tái cơ cấu bộ máy Nhà nước.

3. Hồ sơ khai thuế đối với loại thuế có kỳ tính theo năm

Theo khoản 3 Điều 43 Luật Quản lý thuế 2019, nghĩa vụ khai thuế đối với các loại thuế có kỳ tính theo năm vẫn được giữ nguyên. Doanh nghiệp cần chuẩn bị:

• Hồ sơ khai thuế năm, bao gồm tờ khai và các tài liệu liên quan để xác định số tiền thuế phải nộp.

• Hồ sơ quyết toán thuế cuối năm, gồm tờ khai quyết toán, báo cáo tài chính năm, tờ khai giao dịch liên kết (nếu có) cùng các tài liệu khác có liên quan.

Điều này đảm bảo tính minh bạch, chính xác trong việc xác định nghĩa vụ thuế hàng năm, đồng thời tạo cơ sở pháp lý cho cơ quan thuế trong quá trình thanh tra, kiểm tra.

4. Kết luận

Có thể thấy, việc bãi bỏ lệ phí môn bài từ ngày 01/01/2026 đánh dấu sự thay đổi lớn trong chính sách quản lý thuế, phí tại Việt Nam. Chính sách này không chỉ giúp giảm gánh nặng tài chính cho doanh nghiệp, hộ kinh doanh mà còn góp phần tạo môi trường kinh doanh thuận lợi, thúc đẩy sự phát triển của khu vực kinh tế tư nhân.

Song song với đó, Nghị quyết 198/2025/QH15 đã mở ra hàng loạt chính sách hỗ trợ khác về thuế và phí, từ ưu đãi cho doanh nghiệp khởi nghiệp, miễn giảm cho chuyên gia, nhà khoa học, cho đến các cơ chế hỗ trợ doanh nghiệp nhỏ và vừa. Đây được xem là bước đi chiến lược của Nhà nước nhằm khuyến khích đầu tư, đổi mới sáng tạo và nâng cao năng lực cạnh tranh của nền kinh tế Việt Nam trong giai đoạn mới.

Nếu cần hỗ trợ, hãy liên hệ với đội ngũ pháp lý chuyên nghiệp của Viện Kế Toán qua HOTLINE: 0916.636.419 để được tư vấn và hỗ trợ nhanh chóng, tận tâm.

Xem thêm các dịch vụ của Viện Kế Toán tại:
>> Dịch vụ kê khai thuế ban đầu;
>> Dịch vụ gỡ rối sổ sách kế toán;
>> Dịch vụ quyết toán thuế TNDN
>> Dịch vụ báo cáo thuế, BCTC cuối năm
>> Dịch vụ kế toán trọn gói